重慶醫科大學不是211工程大學，也不屬于985工程。盡管它不是國家211或985項目的一員，但學校在醫學教育和研究方面具有較高的聲譽，特別是在西部地區。

重慶醫科大學擁有多個碩士點、博士點和博士后流動站，以及國家重點學科，其醫學教育和研究實力得到行業認可，尤其在兒科學、內科學、神經醫學和臨床檢驗診斷學等領域有顯著成就。因此，雖然缺乏211或985的標簽，重慶醫科大學在專業領域內的實力不容小覷。

重慶醫科大學的國家重點學科包括：

- 內科學（傳染病）
- 兒科學
- 神經病學
- 臨床檢驗診斷學

這些學科體現了學校在醫學教育和研究方面的核心競爭力，特別是在傳染病、兒科疾病、神經系統疾病以及臨床診斷技術方面具有較高的學術水平和研究實力。此外，學校還有多個學科進入ESI全球前1%行列，如臨床醫學、藥理學與毒理學、神經科學與行為學、生物學與生物化學等，進一步彰顯了其在醫學領域的國際影響力。